Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Msantd4Q91YU3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Msantd4Q91YU3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Msantd4Q91YU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Msantd4Q91YU3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Msantd4Q91YU3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Msantd4Q91YU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Msantd4Q91YU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Msantd4Q91YU3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Msantd4Q91YU3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Msantd4Q91YU3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Msantd4Q91YU3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msantd4Q91YU3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Msantd4Q91YU3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Msantd4Q91YU3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Msantd4Q91YU3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msantd4Q91YU3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Msantd4Q91YU3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Msantd4Q91YU3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Msantd4Q91YU3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Msantd4Q91YU3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Msantd4Q91YU3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Msantd4Q91YU3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Msantd4Q91YU3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Msantd4Q91YU3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Msantd4Q91YU3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Msantd4Q91YU3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Msantd4Q91YU3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Msantd4Q91YU3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Msantd4Q91YU3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Msantd4Q91YU3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Msantd4Q91YU3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Msantd4Q91YU3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msantd4Q91YU3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Msantd4Q91YU3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Msantd4Q91YU3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Msantd4Q91YU3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msantd4Q91YU3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Msantd4Q91YU3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Msantd4Q91YU3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Msantd4Q91YU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Msantd4Q91YU3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Msantd4Q91YU3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Msantd4Q91YU3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Msantd4Q91YU3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Msantd4Q91YU3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Msantd4Q91YU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Msantd4Q91YU3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Msantd4Q91YU3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Msantd4Q91YU3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Msantd4Q91YU3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msantd4Q91YU3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Msantd4Q91YU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Msantd4Q91YU3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Msantd4Q91YU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Msantd4Q91YU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Msantd4Q91YU3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msantd4Q91YU3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Msantd4Q91YU3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Msantd4Q91YU3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msantd4Q91YU3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Msantd4Q91YU3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Msantd4Q91YU3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Msantd4Q91YU3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Msantd4Q91YU3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Msantd4Q91YU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Msantd4Q91YU3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Msantd4Q91YU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msantd4Q91YU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Msantd4Q91YU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Msantd4Q91YU3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Msantd4Q91YU3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Msantd4Q91YU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Msantd4Q91YU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Msantd4Q91YU3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Msantd4Q91YU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Msantd4Q91YU3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Msantd4Q91YU3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Msantd4Q91YU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Msantd4Q91YU3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms