Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cox4i2Q91W29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cox4i2Q91W29 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cox4i2Q91W29 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cox4i2Q91W29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cox4i2Q91W29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cox4i2Q91W29 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cox4i2Q91W29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cox4i2Q91W29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cox4i2Q91W29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cox4i2Q91W29 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cox4i2Q91W29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cox4i2Q91W29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cox4i2Q91W29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cox4i2Q91W29 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cox4i2Q91W29 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cox4i2Q91W29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cox4i2Q91W29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cox4i2Q91W29 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cox4i2Q91W29 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cox4i2Q91W29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cox4i2Q91W29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox4i2Q91W29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox4i2Q91W29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cox4i2Q91W29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox4i2Q91W29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox4i2Q91W29 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cox4i2Q91W29 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cox4i2Q91W29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox4i2Q91W29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cox4i2Q91W29 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cox4i2Q91W29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cox4i2Q91W29 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cox4i2Q91W29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cox4i2Q91W29 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cox4i2Q91W29 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cox4i2Q91W29 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cox4i2Q91W29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms