Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q8VDP2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q8VDP2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q8VDP2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q8VDP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q8VDP2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8VDP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8VDP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8VDP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8VDP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8VDP2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q8VDP2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8VDP2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8VDP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8VDP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8VDP2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Q8VDP2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8VDP2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8VDP2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8VDP2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8VDP2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8VDP2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8VDP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q8VDP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8VDP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8VDP2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8VDP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q8VDP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q8VDP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8VDP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8VDP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8VDP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8VDP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8VDP2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q8VDP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8VDP2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8VDP2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Q8VDP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8VDP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8VDP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8VDP2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8VDP2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8VDP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8VDP2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8VDP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8VDP2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8VDP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8VDP2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8VDP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8VDP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8VDP2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8VDP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8VDP2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8VDP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8VDP2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8VDP2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8VDP2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8VDP2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8VDP2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8VDP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8VDP2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8VDP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8VDP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms