Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttc36Q8VBW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc36Q8VBW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc36Q8VBW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc36Q8VBW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc36Q8VBW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc36Q8VBW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc36Q8VBW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc36Q8VBW8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc36Q8VBW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc36Q8VBW8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc36Q8VBW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc36Q8VBW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc36Q8VBW8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc36Q8VBW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc36Q8VBW8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc36Q8VBW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc36Q8VBW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttc36Q8VBW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc36Q8VBW8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc36Q8VBW8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc36Q8VBW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc36Q8VBW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc36Q8VBW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc36Q8VBW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc36Q8VBW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc36Q8VBW8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc36Q8VBW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc36Q8VBW8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc36Q8VBW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc36Q8VBW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ttc36Q8VBW8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc36Q8VBW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ttc36Q8VBW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms