Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf4Q8K4J2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ebf4Q8K4J2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf4Q8K4J2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf4Q8K4J2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf4Q8K4J2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ebf4Q8K4J2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ebf4Q8K4J2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ebf4Q8K4J2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ebf4Q8K4J2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ebf4Q8K4J2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ebf4Q8K4J2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ebf4Q8K4J2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ebf4Q8K4J2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ebf4Q8K4J2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf4Q8K4J2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ebf4Q8K4J2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ebf4Q8K4J2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ebf4Q8K4J2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ebf4Q8K4J2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ebf4Q8K4J2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ebf4Q8K4J2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ebf4Q8K4J2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ebf4Q8K4J2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf4Q8K4J2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ebf4Q8K4J2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ebf4Q8K4J2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ebf4Q8K4J2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ebf4Q8K4J2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ebf4Q8K4J2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf4Q8K4J2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf4Q8K4J2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf4Q8K4J2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf4Q8K4J2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ebf4Q8K4J2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ebf4Q8K4J2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ebf4Q8K4J2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ebf4Q8K4J2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ebf4Q8K4J2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf4Q8K4J2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ebf4Q8K4J2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms