Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnot6Q8K3P5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnot6Q8K3P5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnot6Q8K3P5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot6Q8K3P5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot6Q8K3P5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot6Q8K3P5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnot6Q8K3P5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnot6Q8K3P5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cnot6Q8K3P5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnot6Q8K3P5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnot6Q8K3P5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnot6Q8K3P5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnot6Q8K3P5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnot6Q8K3P5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnot6Q8K3P5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cnot6Q8K3P5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot6Q8K3P5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot6Q8K3P5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cnot6Q8K3P5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cnot6Q8K3P5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnot6Q8K3P5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cnot6Q8K3P5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnot6Q8K3P5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cnot6Q8K3P5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnot6Q8K3P5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnot6Q8K3P5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot6Q8K3P5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnot6Q8K3P5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot6Q8K3P5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnot6Q8K3P5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot6Q8K3P5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnot6Q8K3P5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnot6Q8K3P5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnot6Q8K3P5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cnot6Q8K3P5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cnot6Q8K3P5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cnot6Q8K3P5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cnot6Q8K3P5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6Q8K3P5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnot6Q8K3P5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6Q8K3P5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnot6Q8K3P5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnot6Q8K3P5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnot6Q8K3P5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnot6Q8K3P5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnot6Q8K3P5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnot6Q8K3P5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6Q8K3P5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnot6Q8K3P5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnot6Q8K3P5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnot6Q8K3P5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnot6Q8K3P5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnot6Q8K3P5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot6Q8K3P5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnot6Q8K3P5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnot6Q8K3P5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnot6Q8K3P5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnot6Q8K3P5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnot6Q8K3P5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnot6Q8K3P5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms