Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H7

Tcp11l2, T-complex protein 11-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l2Q8K1H7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tcp11l2Q8K1H7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tcp11l2Q8K1H7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tcp11l2Q8K1H7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tcp11l2Q8K1H7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Tcp11l2Q8K1H7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tcp11l2Q8K1H7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tcp11l2Q8K1H7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tcp11l2Q8K1H7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tcp11l2Q8K1H7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tcp11l2Q8K1H7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tcp11l2Q8K1H7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tcp11l2Q8K1H7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tcp11l2Q8K1H7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tcp11l2Q8K1H7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tcp11l2Q8K1H7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Tcp11l2Q8K1H7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tcp11l2Q8K1H7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tcp11l2Q8K1H7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tcp11l2Q8K1H7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tcp11l2Q8K1H7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcp11l2Q8K1H7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcp11l2Q8K1H7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tcp11l2Q8K1H7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tcp11l2Q8K1H7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tcp11l2Q8K1H7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tcp11l2Q8K1H7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcp11l2Q8K1H7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tcp11l2Q8K1H7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tcp11l2Q8K1H7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tcp11l2Q8K1H7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tcp11l2Q8K1H7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcp11l2Q8K1H7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tcp11l2Q8K1H7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tcp11l2Q8K1H7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tcp11l2Q8K1H7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tcp11l2Q8K1H7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcp11l2Q8K1H7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcp11l2Q8K1H7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tcp11l2Q8K1H7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tcp11l2Q8K1H7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Tcp11l2Q8K1H7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcp11l2Q8K1H7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tcp11l2Q8K1H7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tcp11l2Q8K1H7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tcp11l2Q8K1H7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tcp11l2Q8K1H7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tcp11l2Q8K1H7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcp11l2Q8K1H7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcp11l2Q8K1H7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcp11l2Q8K1H7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcp11l2Q8K1H7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tcp11l2Q8K1H7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tcp11l2Q8K1H7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tcp11l2Q8K1H7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tcp11l2Q8K1H7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcp11l2Q8K1H7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tcp11l2Q8K1H7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tcp11l2Q8K1H7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tcp11l2Q8K1H7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tcp11l2Q8K1H7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tcp11l2Q8K1H7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tcp11l2Q8K1H7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tcp11l2Q8K1H7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tcp11l2Q8K1H7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcp11l2Q8K1H7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tcp11l2Q8K1H7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tcp11l2Q8K1H7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tcp11l2Q8K1H7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcp11l2Q8K1H7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcp11l2Q8K1H7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcp11l2Q8K1H7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms