Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx5Q8K1E0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stx5Q8K1E0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stx5Q8K1E0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx5Q8K1E0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx5Q8K1E0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx5Q8K1E0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx5Q8K1E0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx5Q8K1E0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stx5Q8K1E0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx5Q8K1E0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx5Q8K1E0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx5Q8K1E0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx5Q8K1E0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stx5Q8K1E0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx5Q8K1E0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx5Q8K1E0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx5Q8K1E0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx5Q8K1E0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx5Q8K1E0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx5Q8K1E0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx5Q8K1E0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx5Q8K1E0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx5Q8K1E0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx5Q8K1E0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx5Q8K1E0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx5Q8K1E0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx5Q8K1E0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx5Q8K1E0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx5Q8K1E0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx5Q8K1E0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stx5Q8K1E0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx5Q8K1E0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx5Q8K1E0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx5Q8K1E0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx5Q8K1E0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx5Q8K1E0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx5Q8K1E0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx5Q8K1E0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx5Q8K1E0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx5Q8K1E0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx5Q8K1E0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx5Q8K1E0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx5Q8K1E0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx5Q8K1E0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx5Q8K1E0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx5Q8K1E0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx5Q8K1E0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx5Q8K1E0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx5Q8K1E0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx5Q8K1E0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms