Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnppd1Q8K158 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnppd1Q8K158 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnppd1Q8K158 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnppd1Q8K158 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnppd1Q8K158 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnppd1Q8K158 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnppd1Q8K158 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnppd1Q8K158 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnppd1Q8K158 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnppd1Q8K158 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnppd1Q8K158 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnppd1Q8K158 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnppd1Q8K158 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnppd1Q8K158 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnppd1Q8K158 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnppd1Q8K158 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnppd1Q8K158 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnppd1Q8K158 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnppd1Q8K158 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnppd1Q8K158 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnppd1Q8K158 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnppd1Q8K158 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnppd1Q8K158 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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