Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atxn7l2Q8C8K6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atxn7l2Q8C8K6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atxn7l2Q8C8K6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atxn7l2Q8C8K6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atxn7l2Q8C8K6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn7l2Q8C8K6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atxn7l2Q8C8K6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atxn7l2Q8C8K6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atxn7l2Q8C8K6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atxn7l2Q8C8K6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atxn7l2Q8C8K6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atxn7l2Q8C8K6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atxn7l2Q8C8K6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atxn7l2Q8C8K6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atxn7l2Q8C8K6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Atxn7l2Q8C8K6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn7l2Q8C8K6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn7l2Q8C8K6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn7l2Q8C8K6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn7l2Q8C8K6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn7l2Q8C8K6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn7l2Q8C8K6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn7l2Q8C8K6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atxn7l2Q8C8K6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atxn7l2Q8C8K6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atxn7l2Q8C8K6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atxn7l2Q8C8K6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atxn7l2Q8C8K6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atxn7l2Q8C8K6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn7l2Q8C8K6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atxn7l2Q8C8K6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atxn7l2Q8C8K6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atxn7l2Q8C8K6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atxn7l2Q8C8K6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atxn7l2Q8C8K6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atxn7l2Q8C8K6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atxn7l2Q8C8K6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn7l2Q8C8K6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn7l2Q8C8K6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn7l2Q8C8K6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atxn7l2Q8C8K6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atxn7l2Q8C8K6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atxn7l2Q8C8K6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn7l2Q8C8K6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn7l2Q8C8K6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn7l2Q8C8K6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn7l2Q8C8K6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn7l2Q8C8K6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn7l2Q8C8K6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn7l2Q8C8K6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn7l2Q8C8K6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn7l2Q8C8K6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn7l2Q8C8K6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn7l2Q8C8K6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn7l2Q8C8K6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn7l2Q8C8K6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn7l2Q8C8K6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn7l2Q8C8K6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn7l2Q8C8K6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn7l2Q8C8K6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn7l2Q8C8K6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn7l2Q8C8K6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms