Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dclre1bQ8C7W7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dclre1bQ8C7W7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dclre1bQ8C7W7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dclre1bQ8C7W7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Dclre1bQ8C7W7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dclre1bQ8C7W7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dclre1bQ8C7W7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dclre1bQ8C7W7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dclre1bQ8C7W7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dclre1bQ8C7W7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dclre1bQ8C7W7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dclre1bQ8C7W7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dclre1bQ8C7W7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dclre1bQ8C7W7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dclre1bQ8C7W7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dclre1bQ8C7W7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Dclre1bQ8C7W7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dclre1bQ8C7W7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dclre1bQ8C7W7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dclre1bQ8C7W7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dclre1bQ8C7W7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dclre1bQ8C7W7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dclre1bQ8C7W7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dclre1bQ8C7W7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Dclre1bQ8C7W7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dclre1bQ8C7W7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dclre1bQ8C7W7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dclre1bQ8C7W7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dclre1bQ8C7W7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dclre1bQ8C7W7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dclre1bQ8C7W7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dclre1bQ8C7W7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dclre1bQ8C7W7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dclre1bQ8C7W7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dclre1bQ8C7W7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dclre1bQ8C7W7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dclre1bQ8C7W7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dclre1bQ8C7W7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dclre1bQ8C7W7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dclre1bQ8C7W7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dclre1bQ8C7W7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dclre1bQ8C7W7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dclre1bQ8C7W7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dclre1bQ8C7W7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dclre1bQ8C7W7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Dclre1bQ8C7W7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dclre1bQ8C7W7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Dclre1bQ8C7W7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dclre1bQ8C7W7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dclre1bQ8C7W7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dclre1bQ8C7W7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dclre1bQ8C7W7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dclre1bQ8C7W7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dclre1bQ8C7W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dclre1bQ8C7W7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dclre1bQ8C7W7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dclre1bQ8C7W7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.8 ms