Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atg16l1Q8C0J2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atg16l1Q8C0J2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg16l1Q8C0J2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg16l1Q8C0J2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg16l1Q8C0J2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atg16l1Q8C0J2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg16l1Q8C0J2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg16l1Q8C0J2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg16l1Q8C0J2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg16l1Q8C0J2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg16l1Q8C0J2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg16l1Q8C0J2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg16l1Q8C0J2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg16l1Q8C0J2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg16l1Q8C0J2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg16l1Q8C0J2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg16l1Q8C0J2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg16l1Q8C0J2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg16l1Q8C0J2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg16l1Q8C0J2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg16l1Q8C0J2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atg16l1Q8C0J2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atg16l1Q8C0J2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atg16l1Q8C0J2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg16l1Q8C0J2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atg16l1Q8C0J2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atg16l1Q8C0J2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atg16l1Q8C0J2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg16l1Q8C0J2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg16l1Q8C0J2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg16l1Q8C0J2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg16l1Q8C0J2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg16l1Q8C0J2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg16l1Q8C0J2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atg16l1Q8C0J2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atg16l1Q8C0J2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg16l1Q8C0J2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg16l1Q8C0J2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg16l1Q8C0J2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg16l1Q8C0J2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg16l1Q8C0J2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg16l1Q8C0J2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg16l1Q8C0J2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg16l1Q8C0J2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg16l1Q8C0J2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg16l1Q8C0J2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg16l1Q8C0J2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg16l1Q8C0J2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg16l1Q8C0J2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg16l1Q8C0J2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg16l1Q8C0J2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg16l1Q8C0J2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg16l1Q8C0J2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atg16l1Q8C0J2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms