Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc44a2Q8BY89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc44a2Q8BY89 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a2Q8BY89 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc44a2Q8BY89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc44a2Q8BY89 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc44a2Q8BY89 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc44a2Q8BY89 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a2Q8BY89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc44a2Q8BY89 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc44a2Q8BY89 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc44a2Q8BY89 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc44a2Q8BY89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc44a2Q8BY89 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc44a2Q8BY89 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc44a2Q8BY89 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc44a2Q8BY89 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc44a2Q8BY89 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc44a2Q8BY89 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc44a2Q8BY89 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc44a2Q8BY89 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc44a2Q8BY89 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc44a2Q8BY89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc44a2Q8BY89 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc44a2Q8BY89 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc44a2Q8BY89 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a2Q8BY89 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc44a2Q8BY89 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc44a2Q8BY89 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc44a2Q8BY89 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc44a2Q8BY89 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc44a2Q8BY89 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc44a2Q8BY89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a2Q8BY89 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc44a2Q8BY89 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a2Q8BY89 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc44a2Q8BY89 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc44a2Q8BY89 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a2Q8BY89 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc44a2Q8BY89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc44a2Q8BY89 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a2Q8BY89 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc44a2Q8BY89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc44a2Q8BY89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc44a2Q8BY89 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc44a2Q8BY89 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc44a2Q8BY89 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc44a2Q8BY89 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc44a2Q8BY89 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a2Q8BY89 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc44a2Q8BY89 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc44a2Q8BY89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc44a2Q8BY89 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc44a2Q8BY89 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc44a2Q8BY89 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a2Q8BY89 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a2Q8BY89 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc44a2Q8BY89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a2Q8BY89 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc44a2Q8BY89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc44a2Q8BY89 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc44a2Q8BY89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc44a2Q8BY89 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a2Q8BY89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc44a2Q8BY89 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms