Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube3dQ8BX13 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube3dQ8BX13 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube3dQ8BX13 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3dQ8BX13 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3dQ8BX13 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3dQ8BX13 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3dQ8BX13 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3dQ8BX13 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3dQ8BX13 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3dQ8BX13 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube3dQ8BX13 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3dQ8BX13 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube3dQ8BX13 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube3dQ8BX13 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3dQ8BX13 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube3dQ8BX13 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3dQ8BX13 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube3dQ8BX13 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ube3dQ8BX13 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3dQ8BX13 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ube3dQ8BX13 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ube3dQ8BX13 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ube3dQ8BX13 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3dQ8BX13 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ube3dQ8BX13 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube3dQ8BX13 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube3dQ8BX13 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube3dQ8BX13 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube3dQ8BX13 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube3dQ8BX13 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube3dQ8BX13 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube3dQ8BX13 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube3dQ8BX13 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube3dQ8BX13 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ube3dQ8BX13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ube3dQ8BX13 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3dQ8BX13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube3dQ8BX13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ube3dQ8BX13 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3dQ8BX13 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3dQ8BX13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3dQ8BX13 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3dQ8BX13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3dQ8BX13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3dQ8BX13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3dQ8BX13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3dQ8BX13 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3dQ8BX13 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3dQ8BX13 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3dQ8BX13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3dQ8BX13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3dQ8BX13 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3dQ8BX13 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3dQ8BX13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3dQ8BX13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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