Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc32Q8BS39 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc32Q8BS39 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc32Q8BS39 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc32Q8BS39 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc32Q8BS39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc32Q8BS39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc32Q8BS39 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc32Q8BS39 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc32Q8BS39 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc32Q8BS39 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc32Q8BS39 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc32Q8BS39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc32Q8BS39 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc32Q8BS39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc32Q8BS39 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc32Q8BS39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc32Q8BS39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc32Q8BS39 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc32Q8BS39 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc32Q8BS39 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc32Q8BS39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc32Q8BS39 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc32Q8BS39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc32Q8BS39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc32Q8BS39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc32Q8BS39 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc32Q8BS39 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc32Q8BS39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc32Q8BS39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc32Q8BS39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc32Q8BS39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc32Q8BS39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc32Q8BS39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc32Q8BS39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc32Q8BS39 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc32Q8BS39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc32Q8BS39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc32Q8BS39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc32Q8BS39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc32Q8BS39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc32Q8BS39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc32Q8BS39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc32Q8BS39 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc32Q8BS39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc32Q8BS39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc32Q8BS39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc32Q8BS39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc32Q8BS39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms