Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf18Q8BM39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf18Q8BM39 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf18Q8BM39 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf18Q8BM39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf18Q8BM39 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf18Q8BM39 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf18Q8BM39 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf18Q8BM39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf18Q8BM39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf18Q8BM39 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf18Q8BM39 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf18Q8BM39 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf18Q8BM39 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf18Q8BM39 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf18Q8BM39 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prpf18Q8BM39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf18Q8BM39 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prpf18Q8BM39 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prpf18Q8BM39 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prpf18Q8BM39 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf18Q8BM39 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf18Q8BM39 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf18Q8BM39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prpf18Q8BM39 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf18Q8BM39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf18Q8BM39 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf18Q8BM39 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf18Q8BM39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf18Q8BM39 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf18Q8BM39 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf18Q8BM39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf18Q8BM39 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf18Q8BM39 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf18Q8BM39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf18Q8BM39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf18Q8BM39 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf18Q8BM39 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf18Q8BM39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Prpf18Q8BM39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf18Q8BM39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf18Q8BM39 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf18Q8BM39 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf18Q8BM39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf18Q8BM39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf18Q8BM39 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prpf18Q8BM39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf18Q8BM39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf18Q8BM39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf18Q8BM39 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf18Q8BM39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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