Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn3Q8BHH8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn3Q8BHH8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn3Q8BHH8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn3Q8BHH8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clrn3Q8BHH8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn3Q8BHH8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn3Q8BHH8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn3Q8BHH8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn3Q8BHH8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clrn3Q8BHH8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn3Q8BHH8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn3Q8BHH8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn3Q8BHH8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn3Q8BHH8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clrn3Q8BHH8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clrn3Q8BHH8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn3Q8BHH8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clrn3Q8BHH8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clrn3Q8BHH8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clrn3Q8BHH8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clrn3Q8BHH8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clrn3Q8BHH8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn3Q8BHH8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clrn3Q8BHH8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn3Q8BHH8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clrn3Q8BHH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clrn3Q8BHH8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clrn3Q8BHH8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn3Q8BHH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clrn3Q8BHH8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clrn3Q8BHH8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clrn3Q8BHH8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clrn3Q8BHH8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Clrn3Q8BHH8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clrn3Q8BHH8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn3Q8BHH8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clrn3Q8BHH8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clrn3Q8BHH8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clrn3Q8BHH8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clrn3Q8BHH8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clrn3Q8BHH8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn3Q8BHH8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn3Q8BHH8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clrn3Q8BHH8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clrn3Q8BHH8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clrn3Q8BHH8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clrn3Q8BHH8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clrn3Q8BHH8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clrn3Q8BHH8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clrn3Q8BHH8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clrn3Q8BHH8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn3Q8BHH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clrn3Q8BHH8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn3Q8BHH8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn3Q8BHH8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn3Q8BHH8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn3Q8BHH8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn3Q8BHH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn3Q8BHH8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clrn3Q8BHH8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn3Q8BHH8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clrn3Q8BHH8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms