Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc50Q810U5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc50Q810U5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc50Q810U5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc50Q810U5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc50Q810U5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc50Q810U5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc50Q810U5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc50Q810U5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc50Q810U5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc50Q810U5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc50Q810U5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc50Q810U5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc50Q810U5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc50Q810U5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc50Q810U5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc50Q810U5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc50Q810U5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc50Q810U5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc50Q810U5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc50Q810U5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc50Q810U5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc50Q810U5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc50Q810U5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc50Q810U5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc50Q810U5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc50Q810U5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc50Q810U5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc50Q810U5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc50Q810U5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc50Q810U5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc50Q810U5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc50Q810U5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc50Q810U5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc50Q810U5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc50Q810U5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc50Q810U5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc50Q810U5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc50Q810U5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc50Q810U5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc50Q810U5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc50Q810U5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc50Q810U5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc50Q810U5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc50Q810U5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc50Q810U5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc50Q810U5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc50Q810U5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc50Q810U5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc50Q810U5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc50Q810U5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc50Q810U5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc50Q810U5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc50Q810U5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc50Q810U5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc50Q810U5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc50Q810U5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms