Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pnma8aQ80VM8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnma8aQ80VM8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnma8aQ80VM8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pnma8aQ80VM8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pnma8aQ80VM8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pnma8aQ80VM8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pnma8aQ80VM8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnma8aQ80VM8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pnma8aQ80VM8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pnma8aQ80VM8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pnma8aQ80VM8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pnma8aQ80VM8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pnma8aQ80VM8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pnma8aQ80VM8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pnma8aQ80VM8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pnma8aQ80VM8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pnma8aQ80VM8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pnma8aQ80VM8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pnma8aQ80VM8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pnma8aQ80VM8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pnma8aQ80VM8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pnma8aQ80VM8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pnma8aQ80VM8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma8aQ80VM8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma8aQ80VM8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pnma8aQ80VM8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnma8aQ80VM8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnma8aQ80VM8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnma8aQ80VM8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnma8aQ80VM8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pnma8aQ80VM8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma8aQ80VM8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnma8aQ80VM8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pnma8aQ80VM8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnma8aQ80VM8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma8aQ80VM8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma8aQ80VM8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnma8aQ80VM8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnma8aQ80VM8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnma8aQ80VM8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma8aQ80VM8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnma8aQ80VM8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pnma8aQ80VM8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pnma8aQ80VM8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pnma8aQ80VM8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pnma8aQ80VM8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnma8aQ80VM8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pnma8aQ80VM8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnma8aQ80VM8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pnma8aQ80VM8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pnma8aQ80VM8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnma8aQ80VM8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnma8aQ80VM8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnma8aQ80VM8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnma8aQ80VM8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnma8aQ80VM8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnma8aQ80VM8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnma8aQ80VM8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnma8aQ80VM8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pnma8aQ80VM8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnma8aQ80VM8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnma8aQ80VM8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnma8aQ80VM8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnma8aQ80VM8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pnma8aQ80VM8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pnma8aQ80VM8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pnma8aQ80VM8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnma8aQ80VM8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pnma8aQ80VM8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pnma8aQ80VM8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pnma8aQ80VM8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma8aQ80VM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma8aQ80VM8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pnma8aQ80VM8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnma8aQ80VM8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pnma8aQ80VM8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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