Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc22a20Q80UJ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc22a20Q80UJ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc22a20Q80UJ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc22a20Q80UJ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc22a20Q80UJ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc22a20Q80UJ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc22a20Q80UJ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc22a20Q80UJ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc22a20Q80UJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc22a20Q80UJ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc22a20Q80UJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc22a20Q80UJ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a20Q80UJ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a20Q80UJ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a20Q80UJ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a20Q80UJ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a20Q80UJ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a20Q80UJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a20Q80UJ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a20Q80UJ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc22a20Q80UJ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a20Q80UJ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a20Q80UJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a20Q80UJ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a20Q80UJ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a20Q80UJ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a20Q80UJ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a20Q80UJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc22a20Q80UJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a20Q80UJ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a20Q80UJ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc22a20Q80UJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a20Q80UJ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a20Q80UJ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a20Q80UJ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a20Q80UJ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc22a20Q80UJ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc22a20Q80UJ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc22a20Q80UJ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a20Q80UJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc22a20Q80UJ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc22a20Q80UJ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a20Q80UJ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc22a20Q80UJ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc22a20Q80UJ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a20Q80UJ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a20Q80UJ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc22a20Q80UJ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc22a20Q80UJ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc22a20Q80UJ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc22a20Q80UJ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc22a20Q80UJ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc22a20Q80UJ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc22a20Q80UJ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms