Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT23

Uncharacterized protein C20orf194 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7TT23 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Q7TT23 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Q7TT23 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Q7TT23 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Q7TT23 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Q7TT23 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Q7TT23 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Q7TT23 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Q7TT23 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Q7TT23 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Q7TT23 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Q7TT23 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Q7TT23 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Q7TT23 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Q7TT23 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Q7TT23 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Q7TT23 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Q7TT23 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Q7TT23 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Q7TT23 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Q7TT23 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Q7TT23 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Q7TT23 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Q7TT23 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Q7TT23 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Q7TT23 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Q7TT23 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Q7TT23 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Q7TT23 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Q7TT23 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Q7TT23 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Q7TT23 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Q7TT23 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Q7TT23 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Q7TT23 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Q7TT23 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Q7TT23 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Q7TT23 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Q7TT23 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Q7TT23 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Q7TT23 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Q7TT23 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Q7TT23 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Q7TT23 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Q7TT23 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Q7TT23 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Q7TT23 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Q7TT23 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Q7TT23 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Q7TT23 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Q7TT23 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Q7TT23 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Q7TT23 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Q7TT23 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Q7TT23 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Q7TT23 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Q7TT23 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Q7TT23 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Q7TT23 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Q7TT23 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Q7TT23 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Q7TT23 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Q7TT23 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Q7TT23 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Q7TT23 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Q7TT23 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Q7TT23 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Q7TT23 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Q7TT23 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Q7TT23 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Q7TT23 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Q7TT23 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Q7TT23 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Q7TT23 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Q7TT23 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Q7TT23 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Q7TT23 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Q7TT23 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Q7TT23 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Q7TT23 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Q7TT23 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Q7TT23 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Q7TT23 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Q7TT23 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Q7TT23 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Q7TT23 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Q7TT23 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Q7TT23 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Q7TT23 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Q7TT23 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Q7TT23 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Q7TT23 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Q7TT23 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Q7TT23 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Q7TT23 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Q7TT23 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Q7TT23 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Q7TT23 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Q7TT23 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Q7TT23 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms