Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rps6ka6Q7TPS0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka6Q7TPS0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rps6ka6Q7TPS0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6ka6Q7TPS0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6ka6Q7TPS0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rps6ka6Q7TPS0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka6Q7TPS0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rps6ka6Q7TPS0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka6Q7TPS0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6ka6Q7TPS0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6ka6Q7TPS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6ka6Q7TPS0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rps6ka6Q7TPS0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka6Q7TPS0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka6Q7TPS0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka6Q7TPS0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6ka6Q7TPS0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6ka6Q7TPS0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rps6ka6Q7TPS0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rps6ka6Q7TPS0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6ka6Q7TPS0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rps6ka6Q7TPS0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rps6ka6Q7TPS0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rps6ka6Q7TPS0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6ka6Q7TPS0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rps6ka6Q7TPS0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rps6ka6Q7TPS0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka6Q7TPS0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rps6ka6Q7TPS0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rps6ka6Q7TPS0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rps6ka6Q7TPS0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rps6ka6Q7TPS0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rps6ka6Q7TPS0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rps6ka6Q7TPS0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rps6ka6Q7TPS0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rps6ka6Q7TPS0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6ka6Q7TPS0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6ka6Q7TPS0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rps6ka6Q7TPS0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rps6ka6Q7TPS0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rps6ka6Q7TPS0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rps6ka6Q7TPS0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka6Q7TPS0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka6Q7TPS0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka6Q7TPS0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka6Q7TPS0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka6Q7TPS0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka6Q7TPS0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rps6ka6Q7TPS0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rps6ka6Q7TPS0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6ka6Q7TPS0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6ka6Q7TPS0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rps6ka6Q7TPS0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rps6ka6Q7TPS0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka6Q7TPS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6ka6Q7TPS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6ka6Q7TPS0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6ka6Q7TPS0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka6Q7TPS0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka6Q7TPS0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka6Q7TPS0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka6Q7TPS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka6Q7TPS0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka6Q7TPS0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms