Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri1Q7TMF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri1Q7TMF2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Eri1Q7TMF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eri1Q7TMF2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eri1Q7TMF2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eri1Q7TMF2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eri1Q7TMF2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eri1Q7TMF2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eri1Q7TMF2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eri1Q7TMF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri1Q7TMF2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eri1Q7TMF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Eri1Q7TMF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Eri1Q7TMF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Eri1Q7TMF2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Eri1Q7TMF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Eri1Q7TMF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Eri1Q7TMF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eri1Q7TMF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Eri1Q7TMF2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Eri1Q7TMF2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Eri1Q7TMF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eri1Q7TMF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eri1Q7TMF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eri1Q7TMF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eri1Q7TMF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eri1Q7TMF2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eri1Q7TMF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eri1Q7TMF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eri1Q7TMF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eri1Q7TMF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eri1Q7TMF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eri1Q7TMF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eri1Q7TMF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eri1Q7TMF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eri1Q7TMF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eri1Q7TMF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Eri1Q7TMF2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eri1Q7TMF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eri1Q7TMF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eri1Q7TMF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eri1Q7TMF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri1Q7TMF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri1Q7TMF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri1Q7TMF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri1Q7TMF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri1Q7TMF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Eri1Q7TMF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Eri1Q7TMF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms