Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Flrt1Q6RKD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Flrt1Q6RKD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Flrt1Q6RKD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Flrt1Q6RKD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Flrt1Q6RKD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Flrt1Q6RKD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Flrt1Q6RKD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Flrt1Q6RKD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flrt1Q6RKD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flrt1Q6RKD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Flrt1Q6RKD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flrt1Q6RKD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flrt1Q6RKD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flrt1Q6RKD8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Flrt1Q6RKD8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Flrt1Q6RKD8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Flrt1Q6RKD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Flrt1Q6RKD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Flrt1Q6RKD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Flrt1Q6RKD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Flrt1Q6RKD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Flrt1Q6RKD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Flrt1Q6RKD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Flrt1Q6RKD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Flrt1Q6RKD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Flrt1Q6RKD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Flrt1Q6RKD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Flrt1Q6RKD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flrt1Q6RKD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flrt1Q6RKD8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flrt1Q6RKD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Flrt1Q6RKD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Flrt1Q6RKD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flrt1Q6RKD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Flrt1Q6RKD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Flrt1Q6RKD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Flrt1Q6RKD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Flrt1Q6RKD8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Flrt1Q6RKD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Flrt1Q6RKD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Flrt1Q6RKD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Flrt1Q6RKD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Flrt1Q6RKD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Flrt1Q6RKD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Flrt1Q6RKD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Flrt1Q6RKD8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Flrt1Q6RKD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Flrt1Q6RKD8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Flrt1Q6RKD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms