Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8Y7

Snx31, Sorting nexin-31, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx31Q6P8Y7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx31Q6P8Y7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx31Q6P8Y7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx31Q6P8Y7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx31Q6P8Y7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snx31Q6P8Y7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx31Q6P8Y7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx31Q6P8Y7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx31Q6P8Y7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx31Q6P8Y7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx31Q6P8Y7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx31Q6P8Y7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx31Q6P8Y7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx31Q6P8Y7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx31Q6P8Y7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx31Q6P8Y7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx31Q6P8Y7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snx31Q6P8Y7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx31Q6P8Y7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx31Q6P8Y7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Snx31Q6P8Y7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx31Q6P8Y7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx31Q6P8Y7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx31Q6P8Y7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx31Q6P8Y7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx31Q6P8Y7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx31Q6P8Y7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snx31Q6P8Y7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx31Q6P8Y7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx31Q6P8Y7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx31Q6P8Y7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx31Q6P8Y7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx31Q6P8Y7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx31Q6P8Y7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx31Q6P8Y7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx31Q6P8Y7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx31Q6P8Y7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx31Q6P8Y7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx31Q6P8Y7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx31Q6P8Y7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx31Q6P8Y7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx31Q6P8Y7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx31Q6P8Y7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx31Q6P8Y7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Snx31Q6P8Y7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx31Q6P8Y7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snx31Q6P8Y7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Snx31Q6P8Y7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Snx31Q6P8Y7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snx31Q6P8Y7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Snx31Q6P8Y7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx31Q6P8Y7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snx31Q6P8Y7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snx31Q6P8Y7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx31Q6P8Y7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx31Q6P8Y7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx31Q6P8Y7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx31Q6P8Y7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx31Q6P8Y7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx31Q6P8Y7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx31Q6P8Y7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx31Q6P8Y7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx31Q6P8Y7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx31Q6P8Y7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx31Q6P8Y7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx31Q6P8Y7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx31Q6P8Y7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx31Q6P8Y7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx31Q6P8Y7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms