Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn12Q6JVL5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lcn12Q6JVL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lcn12Q6JVL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lcn12Q6JVL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lcn12Q6JVL5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lcn12Q6JVL5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lcn12Q6JVL5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lcn12Q6JVL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lcn12Q6JVL5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lcn12Q6JVL5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lcn12Q6JVL5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn12Q6JVL5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lcn12Q6JVL5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lcn12Q6JVL5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lcn12Q6JVL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lcn12Q6JVL5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lcn12Q6JVL5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lcn12Q6JVL5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lcn12Q6JVL5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lcn12Q6JVL5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lcn12Q6JVL5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lcn12Q6JVL5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lcn12Q6JVL5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn12Q6JVL5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lcn12Q6JVL5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lcn12Q6JVL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lcn12Q6JVL5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lcn12Q6JVL5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lcn12Q6JVL5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lcn12Q6JVL5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lcn12Q6JVL5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn12Q6JVL5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lcn12Q6JVL5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lcn12Q6JVL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lcn12Q6JVL5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lcn12Q6JVL5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lcn12Q6JVL5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lcn12Q6JVL5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lcn12Q6JVL5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lcn12Q6JVL5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lcn12Q6JVL5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn12Q6JVL5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn12Q6JVL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn12Q6JVL5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn12Q6JVL5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn12Q6JVL5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn12Q6JVL5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lcn12Q6JVL5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lcn12Q6JVL5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms