Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Capn11Q6J756 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn11Q6J756 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Capn11Q6J756 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn11Q6J756 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn11Q6J756 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Capn11Q6J756 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Capn11Q6J756 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Capn11Q6J756 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Capn11Q6J756 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Capn11Q6J756 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Capn11Q6J756 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn11Q6J756 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Capn11Q6J756 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Capn11Q6J756 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Capn11Q6J756 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Capn11Q6J756 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn11Q6J756 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn11Q6J756 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn11Q6J756 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn11Q6J756 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn11Q6J756 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn11Q6J756 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn11Q6J756 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn11Q6J756 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn11Q6J756 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn11Q6J756 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn11Q6J756 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn11Q6J756 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn11Q6J756 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn11Q6J756 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Capn11Q6J756 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn11Q6J756 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn11Q6J756 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn11Q6J756 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn11Q6J756 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Capn11Q6J756 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn11Q6J756 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn11Q6J756 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn11Q6J756 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn11Q6J756 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn11Q6J756 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn11Q6J756 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn11Q6J756 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn11Q6J756 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn11Q6J756 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn11Q6J756 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn11Q6J756 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn11Q6J756 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn11Q6J756 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn11Q6J756 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn11Q6J756 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms