Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm5416Q6IE28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5416Q6IE28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm5416Q6IE28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5416Q6IE28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm5416Q6IE28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm5416Q6IE28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm5416Q6IE28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm5416Q6IE28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5416Q6IE28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5416Q6IE28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5416Q6IE28 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5416Q6IE28 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5416Q6IE28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5416Q6IE28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5416Q6IE28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5416Q6IE28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5416Q6IE28 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5416Q6IE28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5416Q6IE28 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm5416Q6IE28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5416Q6IE28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5416Q6IE28 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms