Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usf2Q64705 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usf2Q64705 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usf2Q64705 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usf2Q64705 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usf2Q64705 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usf2Q64705 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usf2Q64705 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usf2Q64705 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usf2Q64705 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usf2Q64705 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usf2Q64705 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usf2Q64705 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usf2Q64705 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usf2Q64705 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usf2Q64705 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usf2Q64705 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usf2Q64705 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usf2Q64705 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usf2Q64705 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usf2Q64705 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usf2Q64705 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usf2Q64705 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usf2Q64705 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usf2Q64705 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usf2Q64705 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usf2Q64705 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usf2Q64705 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usf2Q64705 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usf2Q64705 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usf2Q64705 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usf2Q64705 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usf2Q64705 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usf2Q64705 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usf2Q64705 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usf2Q64705 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usf2Q64705 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usf2Q64705 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usf2Q64705 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usf2Q64705 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usf2Q64705 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usf2Q64705 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usf2Q64705 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usf2Q64705 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usf2Q64705 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms