Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx3Q64704 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx3Q64704 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stx3Q64704 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stx3Q64704 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx3Q64704 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx3Q64704 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Stx3Q64704 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stx3Q64704 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx3Q64704 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stx3Q64704 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stx3Q64704 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx3Q64704 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx3Q64704 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx3Q64704 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx3Q64704 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx3Q64704 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx3Q64704 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx3Q64704 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx3Q64704 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx3Q64704 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx3Q64704 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx3Q64704 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx3Q64704 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stx3Q64704 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stx3Q64704 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stx3Q64704 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stx3Q64704 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stx3Q64704 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stx3Q64704 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stx3Q64704 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stx3Q64704 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Stx3Q64704 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Stx3Q64704 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stx3Q64704 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stx3Q64704 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx3Q64704 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx3Q64704 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx3Q64704 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx3Q64704 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx3Q64704 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stx3Q64704 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx3Q64704 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx3Q64704 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx3Q64704 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx3Q64704 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx3Q64704 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx3Q64704 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx3Q64704 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx3Q64704 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx3Q64704 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx3Q64704 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx3Q64704 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx3Q64704 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx3Q64704 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx3Q64704 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx3Q64704 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx3Q64704 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stx3Q64704 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stx3Q64704 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx3Q64704 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx3Q64704 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms