Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt33bQ61897 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt33bQ61897 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt33bQ61897 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt33bQ61897 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt33bQ61897 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt33bQ61897 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt33bQ61897 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt33bQ61897 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt33bQ61897 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt33bQ61897 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt33bQ61897 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt33bQ61897 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt33bQ61897 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt33bQ61897 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt33bQ61897 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt33bQ61897 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt33bQ61897 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt33bQ61897 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt33bQ61897 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt33bQ61897 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt33bQ61897 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt33bQ61897 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt33bQ61897 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt33bQ61897 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt33bQ61897 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt33bQ61897 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt33bQ61897 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt33bQ61897 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt33bQ61897 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt33bQ61897 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt33bQ61897 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt33bQ61897 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt33bQ61897 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt33bQ61897 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt33bQ61897 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt33bQ61897 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt33bQ61897 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt33bQ61897 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt33bQ61897 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt33bQ61897 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt33bQ61897 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt33bQ61897 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt33bQ61897 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt33bQ61897 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt33bQ61897 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.4 ms