Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Itm2aQ61500 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
Itm2aQ61500 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Itm2aQ61500 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itm2aQ61500 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itm2aQ61500 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itm2aQ61500 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itm2aQ61500 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Itm2aQ61500 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itm2aQ61500 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itm2aQ61500 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itm2aQ61500 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itm2aQ61500 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Itm2aQ61500 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itm2aQ61500 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itm2aQ61500 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Itm2aQ61500 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itm2aQ61500 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itm2aQ61500 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itm2aQ61500 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itm2aQ61500 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Itm2aQ61500 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itm2aQ61500 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itm2aQ61500 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Itm2aQ61500 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itm2aQ61500 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itm2aQ61500 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itm2aQ61500 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Itm2aQ61500 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itm2aQ61500 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Itm2aQ61500 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Itm2aQ61500 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itm2aQ61500 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itm2aQ61500 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Itm2aQ61500 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itm2aQ61500 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itm2aQ61500 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itm2aQ61500 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itm2aQ61500 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itm2aQ61500 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itm2aQ61500 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itm2aQ61500 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Itm2aQ61500 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itm2aQ61500 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itm2aQ61500 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itm2aQ61500 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itm2aQ61500 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itm2aQ61500 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itm2aQ61500 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2aQ61500 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itm2aQ61500 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itm2aQ61500 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itm2aQ61500 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itm2aQ61500 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itm2aQ61500 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itm2aQ61500 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itm2aQ61500 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.9 ms