Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snta1Q61234 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snta1Q61234 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snta1Q61234 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snta1Q61234 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snta1Q61234 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snta1Q61234 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snta1Q61234 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snta1Q61234 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snta1Q61234 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snta1Q61234 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snta1Q61234 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snta1Q61234 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snta1Q61234 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snta1Q61234 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snta1Q61234 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snta1Q61234 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snta1Q61234 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snta1Q61234 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snta1Q61234 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snta1Q61234 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snta1Q61234 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snta1Q61234 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snta1Q61234 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snta1Q61234 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snta1Q61234 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Snta1Q61234 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Snta1Q61234 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snta1Q61234 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snta1Q61234 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snta1Q61234 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snta1Q61234 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snta1Q61234 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snta1Q61234 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snta1Q61234 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snta1Q61234 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snta1Q61234 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snta1Q61234 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snta1Q61234 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snta1Q61234 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snta1Q61234 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snta1Q61234 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snta1Q61234 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snta1Q61234 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snta1Q61234 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snta1Q61234 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snta1Q61234 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snta1Q61234 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snta1Q61234 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snta1Q61234 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snta1Q61234 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snta1Q61234 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snta1Q61234 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms