Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lcp1Q61233 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lcp1Q61233 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lcp1Q61233 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lcp1Q61233 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lcp1Q61233 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lcp1Q61233 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lcp1Q61233 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lcp1Q61233 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lcp1Q61233 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lcp1Q61233 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lcp1Q61233 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lcp1Q61233 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lcp1Q61233 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lcp1Q61233 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lcp1Q61233 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lcp1Q61233 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lcp1Q61233 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lcp1Q61233 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lcp1Q61233 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lcp1Q61233 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lcp1Q61233 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lcp1Q61233 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lcp1Q61233 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lcp1Q61233 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lcp1Q61233 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lcp1Q61233 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lcp1Q61233 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lcp1Q61233 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lcp1Q61233 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lcp1Q61233 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lcp1Q61233 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lcp1Q61233 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lcp1Q61233 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lcp1Q61233 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lcp1Q61233 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lcp1Q61233 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lcp1Q61233 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lcp1Q61233 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lcp1Q61233 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lcp1Q61233 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lcp1Q61233 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lcp1Q61233 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lcp1Q61233 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lcp1Q61233 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lcp1Q61233 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lcp1Q61233 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lcp1Q61233 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lcp1Q61233 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lcp1Q61233 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lcp1Q61233 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lcp1Q61233 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lcp1Q61233 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lcp1Q61233 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lcp1Q61233 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lcp1Q61233 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lcp1Q61233 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lcp1Q61233 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lcp1Q61233 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lcp1Q61233 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lcp1Q61233 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lcp1Q61233 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lcp1Q61233 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lcp1Q61233 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lcp1Q61233 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lcp1Q61233 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lcp1Q61233 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lcp1Q61233 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms