Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clns1aQ61189 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clns1aQ61189 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clns1aQ61189 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clns1aQ61189 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clns1aQ61189 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clns1aQ61189 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clns1aQ61189 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clns1aQ61189 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clns1aQ61189 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clns1aQ61189 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clns1aQ61189 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clns1aQ61189 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clns1aQ61189 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clns1aQ61189 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clns1aQ61189 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clns1aQ61189 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clns1aQ61189 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clns1aQ61189 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clns1aQ61189 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clns1aQ61189 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clns1aQ61189 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clns1aQ61189 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clns1aQ61189 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clns1aQ61189 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clns1aQ61189 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clns1aQ61189 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clns1aQ61189 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clns1aQ61189 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clns1aQ61189 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clns1aQ61189 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clns1aQ61189 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clns1aQ61189 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clns1aQ61189 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clns1aQ61189 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clns1aQ61189 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clns1aQ61189 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clns1aQ61189 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clns1aQ61189 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clns1aQ61189 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clns1aQ61189 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clns1aQ61189 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clns1aQ61189 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clns1aQ61189 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms