Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spin1Q61142 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Spin1Q61142 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spin1Q61142 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spin1Q61142 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spin1Q61142 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spin1Q61142 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spin1Q61142 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spin1Q61142 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spin1Q61142 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spin1Q61142 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spin1Q61142 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Spin1Q61142 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spin1Q61142 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spin1Q61142 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spin1Q61142 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spin1Q61142 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spin1Q61142 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spin1Q61142 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spin1Q61142 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Spin1Q61142 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Spin1Q61142 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spin1Q61142 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spin1Q61142 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Spin1Q61142 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spin1Q61142 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spin1Q61142 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spin1Q61142 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Spin1Q61142 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spin1Q61142 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spin1Q61142 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spin1Q61142 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Spin1Q61142 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin1Q61142 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Spin1Q61142 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spin1Q61142 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin1Q61142 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spin1Q61142 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spin1Q61142 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin1Q61142 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin1Q61142 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin1Q61142 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin1Q61142 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spin1Q61142 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spin1Q61142 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin1Q61142 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spin1Q61142 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spin1Q61142 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spin1Q61142 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spin1Q61142 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.4 ms