Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamb3Q61087 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamb3Q61087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lamb3Q61087 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lamb3Q61087 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Lamb3Q61087 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamb3Q61087 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamb3Q61087 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamb3Q61087 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lamb3Q61087 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lamb3Q61087 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamb3Q61087 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamb3Q61087 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamb3Q61087 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lamb3Q61087 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamb3Q61087 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lamb3Q61087 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamb3Q61087 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamb3Q61087 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamb3Q61087 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamb3Q61087 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamb3Q61087 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamb3Q61087 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lamb3Q61087 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lamb3Q61087 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lamb3Q61087 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamb3Q61087 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamb3Q61087 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamb3Q61087 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb3Q61087 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb3Q61087 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb3Q61087 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamb3Q61087 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamb3Q61087 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamb3Q61087 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamb3Q61087 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamb3Q61087 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamb3Q61087 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamb3Q61087 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamb3Q61087 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamb3Q61087 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamb3Q61087 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lamb3Q61087 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamb3Q61087 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamb3Q61087 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamb3Q61087 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lamb3Q61087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamb3Q61087 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamb3Q61087 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamb3Q61087 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamb3Q61087 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamb3Q61087 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamb3Q61087 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamb3Q61087 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamb3Q61087 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lamb3Q61087 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamb3Q61087 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamb3Q61087 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamb3Q61087 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamb3Q61087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamb3Q61087 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamb3Q61087 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamb3Q61087 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamb3Q61087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamb3Q61087 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lamb3Q61087 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamb3Q61087 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222 ms