Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PmlQ60953 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PmlQ60953 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PmlQ60953 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PmlQ60953 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PmlQ60953 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PmlQ60953 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PmlQ60953 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PmlQ60953 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PmlQ60953 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PmlQ60953 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PmlQ60953 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PmlQ60953 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PmlQ60953 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PmlQ60953 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PmlQ60953 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PmlQ60953 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PmlQ60953 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PmlQ60953 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PmlQ60953 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PmlQ60953 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PmlQ60953 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PmlQ60953 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PmlQ60953 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PmlQ60953 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PmlQ60953 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PmlQ60953 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PmlQ60953 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PmlQ60953 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PmlQ60953 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PmlQ60953 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PmlQ60953 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PmlQ60953 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PmlQ60953 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PmlQ60953 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PmlQ60953 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PmlQ60953 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PmlQ60953 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PmlQ60953 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PmlQ60953 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PmlQ60953 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PmlQ60953 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PmlQ60953 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PmlQ60953 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PmlQ60953 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PmlQ60953 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PmlQ60953 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PmlQ60953 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PmlQ60953 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PmlQ60953 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PmlQ60953 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PmlQ60953 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PmlQ60953 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PmlQ60953 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PmlQ60953 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PmlQ60953 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PmlQ60953 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PmlQ60953 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PmlQ60953 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PmlQ60953 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PmlQ60953 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PmlQ60953 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PmlQ60953 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PmlQ60953 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PmlQ60953 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PmlQ60953 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PmlQ60953 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PmlQ60953 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PmlQ60953 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms