Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vdac1Q60932 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vdac1Q60932 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vdac1Q60932 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vdac1Q60932 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vdac1Q60932 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vdac1Q60932 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vdac1Q60932 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac1Q60932 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vdac1Q60932 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac1Q60932 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac1Q60932 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vdac1Q60932 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vdac1Q60932 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vdac1Q60932 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vdac1Q60932 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vdac1Q60932 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vdac1Q60932 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac1Q60932 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac1Q60932 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac1Q60932 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vdac1Q60932 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Vdac1Q60932 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vdac1Q60932 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vdac1Q60932 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vdac1Q60932 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vdac1Q60932 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vdac1Q60932 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vdac1Q60932 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vdac1Q60932 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vdac1Q60932 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vdac1Q60932 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vdac1Q60932 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vdac1Q60932 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vdac1Q60932 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vdac1Q60932 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vdac1Q60932 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vdac1Q60932 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vdac1Q60932 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vdac1Q60932 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac1Q60932 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vdac1Q60932 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vdac1Q60932 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vdac1Q60932 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vdac1Q60932 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vdac1Q60932 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac1Q60932 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vdac1Q60932 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vdac1Q60932 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vdac1Q60932 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vdac1Q60932 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vdac1Q60932 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vdac1Q60932 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac1Q60932 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vdac1Q60932 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms