Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmo1Q5SXG7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmo1Q5SXG7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmo1Q5SXG7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmo1Q5SXG7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmo1Q5SXG7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmo1Q5SXG7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmo1Q5SXG7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmo1Q5SXG7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmo1Q5SXG7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmo1Q5SXG7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmo1Q5SXG7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmo1Q5SXG7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmo1Q5SXG7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmo1Q5SXG7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmo1Q5SXG7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmo1Q5SXG7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmo1Q5SXG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmo1Q5SXG7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmo1Q5SXG7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmo1Q5SXG7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmo1Q5SXG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmo1Q5SXG7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmo1Q5SXG7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmo1Q5SXG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmo1Q5SXG7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmo1Q5SXG7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmo1Q5SXG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmo1Q5SXG7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmo1Q5SXG7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmo1Q5SXG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmo1Q5SXG7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmo1Q5SXG7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmo1Q5SXG7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmo1Q5SXG7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmo1Q5SXG7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms