Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tsr1Q5SWD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tsr1Q5SWD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tsr1Q5SWD9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tsr1Q5SWD9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tsr1Q5SWD9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tsr1Q5SWD9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tsr1Q5SWD9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tsr1Q5SWD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tsr1Q5SWD9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tsr1Q5SWD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsr1Q5SWD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tsr1Q5SWD9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsr1Q5SWD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tsr1Q5SWD9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Tsr1Q5SWD9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tsr1Q5SWD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tsr1Q5SWD9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tsr1Q5SWD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tsr1Q5SWD9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsr1Q5SWD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tsr1Q5SWD9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tsr1Q5SWD9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tsr1Q5SWD9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsr1Q5SWD9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tsr1Q5SWD9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsr1Q5SWD9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tsr1Q5SWD9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tsr1Q5SWD9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tsr1Q5SWD9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tsr1Q5SWD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tsr1Q5SWD9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tsr1Q5SWD9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tsr1Q5SWD9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tsr1Q5SWD9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tsr1Q5SWD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tsr1Q5SWD9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tsr1Q5SWD9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tsr1Q5SWD9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tsr1Q5SWD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tsr1Q5SWD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tsr1Q5SWD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tsr1Q5SWD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tsr1Q5SWD9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tsr1Q5SWD9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tsr1Q5SWD9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsr1Q5SWD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tsr1Q5SWD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsr1Q5SWD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tsr1Q5SWD9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tsr1Q5SWD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tsr1Q5SWD9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tsr1Q5SWD9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tsr1Q5SWD9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tsr1Q5SWD9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tsr1Q5SWD9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tsr1Q5SWD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tsr1Q5SWD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tsr1Q5SWD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsr1Q5SWD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms