Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r196Q5SVD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r196Q5SVD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r196Q5SVD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r196Q5SVD5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r196Q5SVD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r196Q5SVD5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r196Q5SVD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r196Q5SVD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vmn1r196Q5SVD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vmn1r196Q5SVD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vmn1r196Q5SVD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r196Q5SVD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r196Q5SVD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r196Q5SVD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r196Q5SVD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r196Q5SVD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r196Q5SVD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn1r196Q5SVD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r196Q5SVD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r196Q5SVD5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r196Q5SVD5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r196Q5SVD5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r196Q5SVD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r196Q5SVD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r196Q5SVD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r196Q5SVD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r196Q5SVD5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms