Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrc3Q5DU56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrc3Q5DU56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrc3Q5DU56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc3Q5DU56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrc3Q5DU56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrc3Q5DU56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrc3Q5DU56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrc3Q5DU56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrc3Q5DU56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrc3Q5DU56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc3Q5DU56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrc3Q5DU56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrc3Q5DU56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrc3Q5DU56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrc3Q5DU56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrc3Q5DU56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc3Q5DU56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrc3Q5DU56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrc3Q5DU56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrc3Q5DU56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrc3Q5DU56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrc3Q5DU56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc3Q5DU56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc3Q5DU56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc3Q5DU56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc3Q5DU56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrc3Q5DU56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc3Q5DU56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrc3Q5DU56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc3Q5DU56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc3Q5DU56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nlrc3Q5DU56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc3Q5DU56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nlrc3Q5DU56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlrc3Q5DU56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrc3Q5DU56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrc3Q5DU56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc3Q5DU56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc3Q5DU56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc3Q5DU56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc3Q5DU56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc3Q5DU56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc3Q5DU56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc3Q5DU56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc3Q5DU56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc3Q5DU56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc3Q5DU56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc3Q5DU56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc3Q5DU56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc3Q5DU56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc3Q5DU56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc3Q5DU56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc3Q5DU56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc3Q5DU56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc3Q5DU56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc3Q5DU56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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