Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sfmbt2Q5DTW2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sfmbt2Q5DTW2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sfmbt2Q5DTW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sfmbt2Q5DTW2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sfmbt2Q5DTW2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sfmbt2Q5DTW2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sfmbt2Q5DTW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sfmbt2Q5DTW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sfmbt2Q5DTW2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sfmbt2Q5DTW2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sfmbt2Q5DTW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sfmbt2Q5DTW2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sfmbt2Q5DTW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sfmbt2Q5DTW2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sfmbt2Q5DTW2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sfmbt2Q5DTW2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sfmbt2Q5DTW2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sfmbt2Q5DTW2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sfmbt2Q5DTW2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sfmbt2Q5DTW2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sfmbt2Q5DTW2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sfmbt2Q5DTW2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sfmbt2Q5DTW2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sfmbt2Q5DTW2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sfmbt2Q5DTW2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sfmbt2Q5DTW2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sfmbt2Q5DTW2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sfmbt2Q5DTW2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt2Q5DTW2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfmbt2Q5DTW2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sfmbt2Q5DTW2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sfmbt2Q5DTW2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sfmbt2Q5DTW2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sfmbt2Q5DTW2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sfmbt2Q5DTW2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sfmbt2Q5DTW2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sfmbt2Q5DTW2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sfmbt2Q5DTW2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sfmbt2Q5DTW2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sfmbt2Q5DTW2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms