Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1td1Q587J6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
L1td1Q587J6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
L1td1Q587J6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
L1td1Q587J6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
L1td1Q587J6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
L1td1Q587J6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1td1Q587J6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
L1td1Q587J6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
L1td1Q587J6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
L1td1Q587J6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
L1td1Q587J6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
L1td1Q587J6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
L1td1Q587J6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
L1td1Q587J6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
L1td1Q587J6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
L1td1Q587J6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
L1td1Q587J6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
L1td1Q587J6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1td1Q587J6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
L1td1Q587J6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
L1td1Q587J6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
L1td1Q587J6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
L1td1Q587J6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
L1td1Q587J6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
L1td1Q587J6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
L1td1Q587J6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
L1td1Q587J6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
L1td1Q587J6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
L1td1Q587J6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
L1td1Q587J6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
L1td1Q587J6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
L1td1Q587J6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
L1td1Q587J6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
L1td1Q587J6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
L1td1Q587J6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
L1td1Q587J6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
L1td1Q587J6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
L1td1Q587J6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
L1td1Q587J6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
L1td1Q587J6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1td1Q587J6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
L1td1Q587J6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
L1td1Q587J6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
L1td1Q587J6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
L1td1Q587J6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
L1td1Q587J6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
L1td1Q587J6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
L1td1Q587J6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
L1td1Q587J6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1td1Q587J6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
L1td1Q587J6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1td1Q587J6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1td1Q587J6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1td1Q587J6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1td1Q587J6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1td1Q587J6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
L1td1Q587J6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
L1td1Q587J6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
L1td1Q587J6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1td1Q587J6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
L1td1Q587J6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
L1td1Q587J6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
L1td1Q587J6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
L1td1Q587J6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
L1td1Q587J6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms