Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q504N7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q504N7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q504N7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q504N7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q504N7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q504N7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q504N7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q504N7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q504N7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q504N7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q504N7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q504N7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q504N7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q504N7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q504N7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q504N7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q504N7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q504N7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q504N7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q504N7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q504N7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q504N7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q504N7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q504N7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q504N7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q504N7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q504N7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q504N7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q504N7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q504N7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q504N7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q504N7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q504N7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q504N7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q504N7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q504N7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q504N7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q504N7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q504N7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q504N7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q504N7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q504N7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q504N7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q504N7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q504N7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q504N7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q504N7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q504N7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q504N7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q504N7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q504N7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q504N7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q504N7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q504N7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q504N7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q504N7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q504N7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q504N7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q504N7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q504N7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q504N7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q504N7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q504N7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q504N7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q504N7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q504N7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q504N7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q504N7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q504N7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q504N7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q504N7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q504N7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q504N7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q504N7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q504N7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q504N7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q504N7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q504N7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q504N7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q504N7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q504N7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q504N7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q504N7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q504N7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q504N7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q504N7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q504N7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q504N7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q504N7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q504N7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q504N7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q504N7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q504N7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q504N7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q504N7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q504N7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q504N7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q504N7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q504N7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms