Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pydc3Q3V3Q4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pydc3Q3V3Q4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pydc3Q3V3Q4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pydc3Q3V3Q4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pydc3Q3V3Q4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pydc3Q3V3Q4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pydc3Q3V3Q4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pydc3Q3V3Q4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pydc3Q3V3Q4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pydc3Q3V3Q4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pydc3Q3V3Q4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pydc3Q3V3Q4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pydc3Q3V3Q4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pydc3Q3V3Q4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pydc3Q3V3Q4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pydc3Q3V3Q4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pydc3Q3V3Q4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pydc3Q3V3Q4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pydc3Q3V3Q4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pydc3Q3V3Q4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pydc3Q3V3Q4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pydc3Q3V3Q4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pydc3Q3V3Q4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pydc3Q3V3Q4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pydc3Q3V3Q4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pydc3Q3V3Q4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pydc3Q3V3Q4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pydc3Q3V3Q4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pydc3Q3V3Q4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pydc3Q3V3Q4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pydc3Q3V3Q4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pydc3Q3V3Q4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pydc3Q3V3Q4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pydc3Q3V3Q4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pydc3Q3V3Q4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pydc3Q3V3Q4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pydc3Q3V3Q4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pydc3Q3V3Q4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pydc3Q3V3Q4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pydc3Q3V3Q4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pydc3Q3V3Q4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pydc3Q3V3Q4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pydc3Q3V3Q4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pydc3Q3V3Q4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pydc3Q3V3Q4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pydc3Q3V3Q4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pydc3Q3V3Q4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pydc3Q3V3Q4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pydc3Q3V3Q4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pydc3Q3V3Q4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pydc3Q3V3Q4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pydc3Q3V3Q4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pydc3Q3V3Q4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pydc3Q3V3Q4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pydc3Q3V3Q4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pydc3Q3V3Q4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pydc3Q3V3Q4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pydc3Q3V3Q4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pydc3Q3V3Q4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pydc3Q3V3Q4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pydc3Q3V3Q4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pydc3Q3V3Q4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pydc3Q3V3Q4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pydc3Q3V3Q4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pydc3Q3V3Q4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms