Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ItgadQ3V0T4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ItgadQ3V0T4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ItgadQ3V0T4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ItgadQ3V0T4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ItgadQ3V0T4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ItgadQ3V0T4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ItgadQ3V0T4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ItgadQ3V0T4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ItgadQ3V0T4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ItgadQ3V0T4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ItgadQ3V0T4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ItgadQ3V0T4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ItgadQ3V0T4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ItgadQ3V0T4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ItgadQ3V0T4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ItgadQ3V0T4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ItgadQ3V0T4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ItgadQ3V0T4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ItgadQ3V0T4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ItgadQ3V0T4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ItgadQ3V0T4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ItgadQ3V0T4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ItgadQ3V0T4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ItgadQ3V0T4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ItgadQ3V0T4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ItgadQ3V0T4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ItgadQ3V0T4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ItgadQ3V0T4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ItgadQ3V0T4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ItgadQ3V0T4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ItgadQ3V0T4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ItgadQ3V0T4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ItgadQ3V0T4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ItgadQ3V0T4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ItgadQ3V0T4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ItgadQ3V0T4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ItgadQ3V0T4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ItgadQ3V0T4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ItgadQ3V0T4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ItgadQ3V0T4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgadQ3V0T4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ItgadQ3V0T4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ItgadQ3V0T4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgadQ3V0T4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ItgadQ3V0T4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms