Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim15Q3UTD9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim15Q3UTD9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim15Q3UTD9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim15Q3UTD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim15Q3UTD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim15Q3UTD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim15Q3UTD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim15Q3UTD9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim15Q3UTD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim15Q3UTD9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim15Q3UTD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim15Q3UTD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim15Q3UTD9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim15Q3UTD9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim15Q3UTD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim15Q3UTD9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim15Q3UTD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smim15Q3UTD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smim15Q3UTD9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smim15Q3UTD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smim15Q3UTD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim15Q3UTD9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim15Q3UTD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smim15Q3UTD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim15Q3UTD9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim15Q3UTD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim15Q3UTD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim15Q3UTD9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms