Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdgfl2Q3UMU9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdgfl2Q3UMU9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdgfl2Q3UMU9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdgfl2Q3UMU9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdgfl2Q3UMU9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdgfl2Q3UMU9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdgfl2Q3UMU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdgfl2Q3UMU9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdgfl2Q3UMU9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdgfl2Q3UMU9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdgfl2Q3UMU9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdgfl2Q3UMU9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdgfl2Q3UMU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdgfl2Q3UMU9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdgfl2Q3UMU9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdgfl2Q3UMU9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdgfl2Q3UMU9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdgfl2Q3UMU9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdgfl2Q3UMU9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdgfl2Q3UMU9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdgfl2Q3UMU9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdgfl2Q3UMU9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hdgfl2Q3UMU9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl2Q3UMU9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hdgfl2Q3UMU9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hdgfl2Q3UMU9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl2Q3UMU9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hdgfl2Q3UMU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hdgfl2Q3UMU9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdgfl2Q3UMU9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hdgfl2Q3UMU9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hdgfl2Q3UMU9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdgfl2Q3UMU9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hdgfl2Q3UMU9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hdgfl2Q3UMU9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hdgfl2Q3UMU9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdgfl2Q3UMU9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdgfl2Q3UMU9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdgfl2Q3UMU9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdgfl2Q3UMU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms